Anthropic lance 50 000 $ de crédits IA pour décrypter les maladies rares

UN NOUVEAU PROGRAMME D'ANTHROPIC POUR L'IA EN MÉDECINE

Au printemps dernier, Anthropic a lancé son programme AI for Science, une initiative visant à accélérer la recherche scientifique grâce à l'accès à son API. Depuis son lancement, ce programme a soutenu des chercheurs travaillant sur des projets variés à fort impact : réutilisation de médicaments, simulation quantique, et bien d'autres. Une observation s'est imposée : les projets gagnent en créativité lorsque plusieurs chercheurs travaillant sur des questions similaires échangent des idées et partagent leurs astuces. Anthropic a donc décidé de lancer des appels à projets thématiques dans le cadre de ce programme.

UNE BOURSE POUR LES MALADIES GÉNÉTIQUES RARES

L'entreprise annonce aujourd'hui un appel à candidatures ciblé sur les maladies génétiques rares. Les projets retenus recevront jusqu'à 50 000 $ de crédits Claude sur six mois. L'objectif ? Créer une communauté de chercheurs pour explorer comment l'IA peut transformer notre compréhension de ces maladies. Ce programme se décline en deux volets : un pour les scientifiques menant des recherches fondamentales, et un autre pour les jeunes entreprises de biotechnologie cherchant à accélérer le développement clinique de traitements contre les maladies rares.

POURQUOI LES MALADIES RARES SONT-ELLES SI DIFFICILES À ÉTUDIER ?

Les maladies rares posent un défi de taille : malgré leur prévalence globale (environ 400 millions de personnes dans le monde souffrent d'une des plus de 7 000 maladies rares connues), elles concernent souvent de très petites populations. Cela rend difficile la constitution de registres de patients, l'identification de cibles thérapeutiques prometteuses, et la conception d'essais cliniques. Chaque maladie rare a ses particularités (une variation génétique spécifique ou une combinaison unique de symptômes), ce qui complique la détection de mécanismes communs entre elles. Autre obstacle majeur : le temps nécessaire pour faire passer un candidat-médicament prometteur des essais précliniques aux essais sur patients.

Anthropic estime que l'IA peut apporter des solutions à ces défis. Elle permet de modéliser avec précision les maladies génétiques rares et de détecter des schémas communs entre elles. Elle aide aussi les chercheurs à synthétiser les résultats issus d'une vaste littérature scientifique, à extraire rapidement des informations de jeux de données limités, et à créer un vocabulaire partagé. Ces outils permettent aux chercheurs d'exploiter au mieux les données dont ils disposent déjà, même si davantage de travaux sont nécessaires pour générer de nouvelles données et surmonter les obstacles liés à l'accès géographique.

DEUX VOIES POUR FINANCER LA RECHERCHE

Le premier volet de ce programme de subventions vise à encourager la collaboration entre chercheurs cliniques, organisations de patients et data scientists. L'objectif est d'accélérer les progrès en recherche fondamentale et la découverte des mécanismes sous-jacents aux maladies rares. Un partenaire clé de cette initiative est le Monarch Initiative, un consortium international dédié à l'amélioration du diagnostic et de la découverte des mécanismes chez les patients atteints de maladies rares.

Le Monarch Initiative développe des normes et des ressources comme la Mondo Disease Ontology, un cadre computationnel et un système de codage qui réconcilie les définitions de maladies dispersées dans des bases comme OMIM, Orphanet ou ICD. Il propose également le Monarch Knowledge Graph, qui intègre des données génotype-phénotype entre espèces pour faciliter le diagnostic et la découverte de mécanismes. Récemment, les contributeurs de Monarch ont assemblé des données et connaissances dans une nouvelle bibliothèque appelée DisMech. Cette ressource, compatible avec les agents, permet à Claude de lire des rapports de cas, des bases de données de variants, des schémas de registres, des données publiques brutes, et bien plus. Elle peut identifier des similitudes mécanistiques entre maladies à une échelle et une vitesse inégalées. Le Monarch Initiative invite les bénéficiaires des subventions à utiliser et contribuer à ses ressources comme Mondo et DisMech pour révéler de nouvelles hypothèses mécanistiques et soutenir le développement de traitements.

L'IA POUR ACCÉLÉRER LE DÉVELOPPEMENT DE MÉDICAMENTS

Le deuxième volet de ce programme soutient les biotechnologistes et les jeunes entreprises de biotech travaillant à accélérer le développement de médicaments pour les maladies rares. Aujourd'hui, il faut entre un et deux ans pour passer d'un diagnostic génétique confirmé à un traitement disponible pour les patients. Ce délai s'explique en grande partie par l'attente de créneaux de fabrication certifiés, la réalisation d'études de sécurité de manière séquentielle plutôt que parallèle, et l'assemblage manuel des milliers de pages de documentation chimique et réglementaire nécessaires pour les essais cliniques.

Anthropic pense qu'il est possible de radicalement compresser certaines phases de ce processus avec Claude. Notamment en facilitant la rédaction et la révision de dossiers réglementaires, en accélérant la sélection de stratégies thérapeutiques (par exemple en analysant si une cible est « druggable » selon plusieurs modalités comme les petites molécules, les anticorps ou les médicaments génétiques), et en recherchant des mécanismes partagés entre thérapies génétiques individuelles. Ces mécanismes partagés pourraient permettre d'obtenir une approbation dans le cadre d'un seul « basket trial » (essai clinique groupé) au lieu de nécessiter un nouveau dossier IND (Investigational New Drug) pour chaque patient.

DES PARTENAIRES DÉJÀ EN ACTION

Bien que certains aspects du développement de médicaments soient difficiles à accélérer en raison de contraintes de fabrication ou de tests de sécurité, Anthropic estime que beaucoup peut être fait pour gagner du temps. En offrant des crédits API et un accès à Claude Science aux nombreux biotechnologistes et startups travaillant dans ce domaine, l'entreprise espère encourager les expériences nécessaires pour explorer et identifier des solutions innovantes.

Parmi les partenaires déjà actifs, on trouve Every Cure, un bénéficiaire du programme AI for Science qui utilise Claude pour identifier des opportunités de repositionnement de médicaments parmi des millions de candidats. Le Centre for Population Genomics, une collaboration entre l'Institut Garvan et l'Institut de recherche de l'hôpital pour enfants Murdoch, construit un système basé sur Claude qui rédige des classifications de variants pour révision par des experts, l'un des goulots d'étranglement majeurs dans le diagnostic des maladies génétiques rares. Enfin, le Violet Research Institute, une petite organisation à but non lucratif dédiée aux maladies génétiques ultra-rares (définies comme touchant moins de 1 personne sur 50 000 naissances), utilise Claude pour naviguer dans les directives de la FDA, exécuter des pipelines de bioinformatique, analyser des données expérimentales, rédiger des dossiers réglementaires, et bien plus.

COMMENT POSTULER AU PROGRAMME ?

Pour postuler à l'un des deux volets du programme de subventions pour la recherche sur les maladies rares, il suffit de remplir ce formulaire. Les candidatures seront acceptées jusqu'au 2 août 2026 à 23h59 PST. Les projets retenus pourront utiliser leurs crédits pour accéder à Claude Opus ou à d'autres modèles généralement disponibles pour la recherche en biologie. Les projets pouvant rencontrer des restrictions liées aux classificateurs biologiques de l'API pourraient être éligibles à des exemptions.

Parmi les exemples de projets du premier volet, on peut citer :

• L'identification de nouveaux mécanismes partagés entre maladies rares
• La création de modèles prédictifs pour le diagnostic précoce
• L'analyse automatisée de rapports de cas pour découvrir des schémas communs

Les résultats de ce premier volet seront rendus publics sur Monarchinitiative.org. Le programme sera enrichi par des efforts supplémentaires de construction de communauté, comme des hackathons dédiés aux maladies rares à l'avenir. Pour rester informé des activités du Monarch Initiative, consultez monarchinitiative.org/community/get-involved.

LES LIMITES DE L'IA DANS LA RECHERCHE SUR LES MALADIES RARES

Ce programme de subventions s'inscrit directement dans la mission d'Anthropic : étendre les bénéfices de l'IA à des domaines qui ne se développeraient pas naturellement par les forces du marché. Cependant, les maladies rares représentent un défi trop vaste pour qu'une seule organisation ou une seule approche puisse le résoudre à elle seule. Anthropic reconnaît aussi les limites de l'IA dans ce domaine. Bien que Claude puisse aider à raccourcir les délais de développement thérapeutique et à organiser des données biologiques plus efficacement que les équipes humaines seules, elle ne peut pas compenser un manque de données ou une organisation trop chaotique. Elle peut aussi avoir du mal à résoudre les aspects de l' « odyssée diagnostique » liés à des défis comme l'autorisation par les assurances ou l'accès aux infrastructures de diagnostic.

Anthropic espère que ce programme sera complété par les efforts d'autres organisations et institutions de recherche pour générer davantage de données longitudinales de haute qualité, ainsi que par des partenariats public-privé robustes.

UNE COMMUNAUTÉ POUR FAIRE AVANCER LA RECHERCHE

Anthropic se réjouit de voir comment ce nouveau groupe de bénéficiaires travaillera ensemble et avec ses autres partenaires du programme AI for Science pour faire avancer la recherche fondamentale et la découverte dans le domaine des maladies rares. Ces projets pourraient aussi contribuer à des initiatives scientifiques plus larges.